Simplifique e acelere a análise de dados genômicos com acesso às melhores ferramentas disponíveis para escalar sob demanda com a AWS para genômica.
Fluxos de trabalho Ready2Run do AWS HealthOmics
Transforme dados genômicos e biológicos em insights
Automatize e acelere a análise secundária
Para ajudar as organizações de genômica a otimizar fluxos de trabalho e reduzir o tempo de análise, a AWS para Genômica oferece uma variedade de soluções e serviços de automação de fluxos de trabalho e análise secundária da AWS e de parceiros da AWS. Serviços gerenciados, como o AWS HealthOmics, fornecem computação de bioinformática totalmente gerenciada.
Casos de uso de análise secundária de genômica
Automação do fluxo de trabalho
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Para executar fluxos de trabalho de genômica, são necessários provisionamento e configurações manuais. A automação de fluxo de trabalho e as ferramentas de orquestração da AWS, os parceiros da AWS e a comunidade de código aberto podem ajudar a acelerar pesquisas e escalar recursos computacionais. Serviços gerenciados como o AWS HealthOmics fornecem computação de bioinformática totalmente gerenciada. Basta trazer seus dados, ferramentas e definição de fluxo de trabalho e executar suas análises genômicas com poucos cliques. Acesse a Biblioteca de soluções.
Soluções da AWS
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Solução: fluxos de trabalho genômicos de automação na AWS com a Amazon Genomics CLI
A Amazon Genomics CLI é uma ferramenta de código aberto que fornece uma interface de linha de comando fácil de usar para configurar e executar fluxos de trabalho genômicos na AWS rapidamente, viabilizando estudos genéticos populacionais mais rápidos e econômicos, ciclos de descoberta de medicamentos e muito mais.
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Orientação para o desenvolvimento de fluxo de trabalho de bioinformática usando DevOps na AWS
Configure um pipeline de integração contínua e entrega contínua (CI/CD) para automatizar o ciclo de vida de seus fluxos de trabalho de bioinformática no AWS HealthOmics.
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orientação para desenvolvimento, automação, implementação e monitoramento de fluxos de trabalho de bioinformática na aws
Crie e execute fluxos de trabalho de bioinformática de nível de produção em grande escala.
Clientes em destaque
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Com a AWS, a Fred Hutch Microbiome Research Initiative reduz o tempo de computação de sete anos para sete dias.
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A Gritstone Oncology usa a AWS e uma fila de trabalhos compartilhada orientada pelo Nextflow para distribuir trabalhos e solucionar o fluxo de dados.
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A Helix usa o BaseSpace Sequence Hub, uma plataforma de análise de dados genômicos da Illumina, para capacitar seu trabalho.
Soluções de parceiros em destaque
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“As principais empresas de diagnóstico e biofarmacêutica utilizam a DNAnexus na AWS para automatizar tarefas recorrentes com grande volume de dados para obter velocidade e precisão. Consequentemente, essas empresas obtêm uma redução considerável em pesquisa e desenvolvimento, acelerando o desenvolvimento de pipelines de semanas para horas.”
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“A Seqera Labs e a AWS colaboraram para garantir que a AWS seja o ambiente escolhido para workloads de ciências biológicas. A Nextflow e o Nextflow Tower se integram de maneira simples ao AWS Batch para obter computação elástica, ao EKS para implantações perfeitas e aos serviços de armazenamento de objetos e arquivos da AWS, obtendo armazenamentos de dados econômicos e de alta performance.”
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“A plataforma e as ferramentas de análise da Seven Bridges, como a GRAF™ e a ARIA™, contam com a flexibilidade e a escalabilidade da AWS para permitir que pesquisadores se beneficiem de grandes repositórios de dados genômicos e fenotípicos. Esses repositórios têm um grande potencial para revelar insights transformadores sobre os fundamentos de doenças, novas abordagens de tratamentos e modelos in silico de doenças.”
Parceiros de consultoria em destaque
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A plataforma DRAGEN Bio-IT da Illumina permite a análise ultrarrápida de dados de sequenciamento de nova geração (NGS) de grandes conjuntos de dados, como genomas completos, exomas e genes ou painéis. A análise inclui mapeamento, alinhamento, classificação, marcação de duplicatas, denominação de pequenas variantes, entre outros.
Análise secundária
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Conforme a adoção da genômica continua acelerando, a análise secundária é bastante mencionada como um obstáculo. Para acelerar a análise e acompanhar o aumento da demanda, as organizações de genômica usufruem da escalabilidade e do custo-benefício da AWS.
Soluções da AWS
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Serviço: AWS HealthOmics para computação de bioinformática totalmente gerenciada
O AWS HealthOmics oferece suporte à análise em grande escala e à pesquisa colaborativa em populações inteiras com armazenamentos de dados com propósito específico, transformando dados genômicos e biológicos brutos em insights de nível de paciente e de saúde da população.
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Solução: DRAGEN na AWS
A Dynamic Read Analysis for Genomics (DRAGEN) da Illumina na AWS permite a análise ultrarrápida de dados de sequenciamento de nova geração.
Clientes em destaque
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A plataforma DRAGEN Bio-IT da Illumina fornece resultados precisos e ultrarrápidos de análises secundárias. Os clientes podem impulsionar e acelerar substancialmente suas análises com a DRAGEN em execução em instâncias F1 do Amazon EC2.
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Com a AWS, o Munich Leukemia Lab reduziu o tempo de resposta para processar dados do genoma dos pacientes de 20 horas para três horas, ajudando a acelerar a pesquisa e melhorar o diagnóstico da leucemia.
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A Ancestry conta com o Amazon EFS para permitir que vários cientistas realizem pesquisas genômicas, aumentem ou diminuam a escala de computação e armazenamento e integrem cientistas mais rapidamente.
Soluções de parceiros em destaque
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“Precisão e velocidade são fundamentais para revelar o poder do genoma humano. A plataforma DRAGEN Bio-IT da Illumina fornece resultados precisos e ultrarrápidos de análises secundárias. Os clientes podem impulsionar e acelerar consideravelmente suas análises com a DRAGEN em execução na AWS.”
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“O NVIDIA Clara Parabricks Pipelines é um framework de computação acelerada por GPU que oferece suporte a aplicações genômicas que prolongam o DNA para RNA. A combinação entre a aceleração do Parabricks e a escalabilidade da AWS está impulsionando o setor de genômica a realizar projetos de forma mais rápida e econômica, além de permitir que pesquisadores identifiquem mais variantes genéticas em seus dados.”
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“A plataforma e as ferramentas de análise da Seven Bridges, como a GRAF™ e a ARIA™, contam com a flexibilidade e a escalabilidade da AWS para permitir que pesquisadores se beneficiem de grandes repositórios de dados genômicos e fenotípicos. Esses repositórios têm um grande potencial para revelar insights transformadores sobre os fundamentos de doenças, novas abordagens de tratamentos e modelos in silico de doenças.”
Parceiros de consultoria em destaque
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Recurso em destaque
Optimizing Secondary Analysis Compute Costs (Como otimizar custos de computação com análise secundária)
Aprenda a otimizar custos de computação com análise secundária usando o Amazon Elastic Compute Cloud (EC2), instâncias spot e o AWS Batch.
Comece a usar
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