Sumber daya AWS HealthOmics
Dokumentasi
-
Panduan Pengguna
Pelajari cara menggunakan AWS HealthOmics dalam panduan developer langkah demi langkah ini.
-
Referensi API
Baca panduan referensi untuk API dan parameter AWS HealthOmics.
Tutorial
-
Lokakarya Menyeluruh HealthOmics
Mulai alur kerja dan penyimpanan HealthOmics
-
Tutorial HealthOmics
Repositori sumber terbuka di GitHub dengan kode contoh yang menunjukkan cara menyimpan, memproses, dan mengueri set data genomika dan biologis menggunakan AWS HealthOmics
Alat
Alat Alur Kerja
Alur Kerja Penemuan Obat
Gunakan kumpulan alur kerja AWS HealthOmics ini untuk mempercepat penemuan obat
Contoh Alur Kerja
Bangun alur kerja privat berdasarkan contoh alur kerja HealthOmics sumber terbuka
Penganalisis Operasi
Penganalisis Operasi adalah alat optimisasi performa operasi yang mengambil log manifes operasi dari CloudWatch dan menghasilkan statistik untuk operasi, termasuk pemanfaatan CPU dan memori untuk tugas alur kerja
WDL Linter
Gunakan WDL linter HealthOmics untuk mendeteksi kesalahan alur kerja umum sebelum menjalankan alur kerja
Nextflow Linter
Lint untuk kesalahan Nextflow umum sebelum skrip alur kerja dijalankan
Pembantu ECR
Migrasikan kontainer yang ada ke repositori ECR privat Anda menggunakan alat pembantu ECR
Jalankan Ulang Alat
Jalankan ulang operasi yang diarsipkan dari log manifes operasi CloudWatch
Alat Penyimpanan Data
Manajer Transfer Set Baca
Unduh file dengan mudah dari referensi AWS HealthOmics atau set baca
Importir yang Didorong Peristiwa
Aplikasi CDK mendemonstrasikan arsitektur yang didorong peristiwa yang mengotomatiskan impor data ke penyimpanan urutan AWS HealthOmics saat objek dibuat di Amazon S3.
Generator Manifes Penyimpanan Urutan
Menghasilkan manifes json untuk tugas impor penyimpanan urutan AWS HealthOmics
Pencari Kumpulan Baca Duplikat Penyimpanan Urutan
Mengidentifikasi set baca duplikat yang disimpan di penyimpanan urutan AWS HealthOmics
Solusi
-
Panduan untuk Jala Data Laboratorium di AWS
Panduan ini menunjukkan cara membangun sistem manajemen data ilmiah yang mengintegrasikan data instrumen laboratorium dan sistem perangkat lunak, seperti notebook lab elektronik (ELN) dan sistem manajemen informasi lab (LIMS), dengan HealthOmics.
-
Panduan untuk Lab yang Terhubung secara Digital di AWS
Panduan ini membantu Anda menghubungkan instrumen data ilmu hayati dan file sistem laboratorium ke AWS Cloud, baik melalui internet maupun koneksi langsung dengan latensi rendah.
-
Panduan untuk Migrasi & Penyimpanan Data Urutan dengan AWS HealthOmics
Panduan ini menunjukkan cara mengimpor data urutan omik dari Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) ke AWS HealthOmics Storage.
-
Panduan untuk Analisis Data Multi-Modal dengan AWS Health dan Layanan ML
Panduan ini menunjukkan cara menyiapkan kerangka kerja ujung ke ujung untuk menganalisis data layanan kesehatan dan ilmu hayati (HCLS) multimodal.
-
Panduan untuk Alur Kerja Bioinformatika di AWS
Panduan ini menunjukkan bagaimana Anda dapat membangun dan menjalankan alur kerja bioinformatika tingkat produksi dalam skala besar dan menggunakan layanan AWS untuk otomatisasi, analisis alur kerja, penyimpanan, serta observabilitas operasional dan biaya.
-
Panduan untuk Analisis Data Multi-Modal dengan AWS Health dan Layanan ML
Panduan ini menunjukkan cara menyiapkan kerangka kerja menyeluruh untuk menganalisis data layanan kesehatan dan ilmu hayati (HCLS) multimodal.
Apa yang Baru
AWS HealthOmics now supports DSL and Nextflow version detection (AWS HealthOmics kini mendukung deteksi versi DSL dan Nextflow)
13/8/24
AWS HealthOmics now supports dynamic run storage for private workflows (AWS HealthOmics kini mendukung penyimpanan operasi dinamis untuk alur kerja privat)
30-4-2024
AWS HealthOmics kini mendukung berbagi lintas akun untuk alur kerja pribadi
30-4-2024
AWS HealthOmics mengumumkan dukungan untuk penyimpanan urutan membaca melalui API Amazon S3
04/15/24
AWS HealthOmics kini menyediakan informasi tambahan untuk alur kerja yang berjalan
23/02/24
AWS HealthOmics kini mendukung alur kerja Ultima Genomics DeepVariant Ready2Run
05/02/24
AWS HealthOmics kini tersedia di Wilayah Israel (Tel Aviv)
26/09/23
AWS HealthOmics kini menyediakan pengarsipan dan retensi alur kerja yang berjalan
08/30/23
AWS HealthOmics kini mendukung penentuan versi penyimpanan anotasi
08/15/23
AWS HealthOmics mendukung berbagi lintas akun dari penyimpanan analitik omics
15/8/23
Posting blog
Merevolusi Biologi Generatif dengan AWS dan EvolutionaryScale
25/06/2024
Cara Takeda Pharmaceuticals Mempercepat Bioinformatika Berskala Besar dengan AWS HealthOmics
19/06/2024
Dapatkan Wawasan Genomika yang Kuat dengan Analitik AWS HealthOmics dan Amazon EMR
30/05/2024
Mengatur Beberapa Alur Kerja AWS HealthOmics dalam Skala Besar
07/05/24
Demokratisasi Analisis Data Omik dengan Basepair di AWS HealthOmics
29/04/2024
Simpan data omik dalam berbagai skala secara hemat biaya dengan AWS HealthOmics
24/01/24
Prapemrosesan Data fMRI di AWS menggunakan AFNI dan AWS HealthOmics
01/08/24
Alat Baru untuk Mempercepat Migrasi Alur Kerja ke AWS HealthOmics
12/13/23
Analisis Data Multimodal dengan Layanan AWS Health dan Machine Learning
10/16/23
Amankan Alur Kerja dan Data Genomik Anda dengan AWS HealthOmics
09/10/23
Video
Mengatasi Tantangan Ilmiah dan IT yang Terkait dengan Analisis Omics Penskalaan (22:11)
Merevolusi pengobatan presisi: Sonrai menggunakan AWS untuk penemuan obat (3:03)
AWS Re:Invent 2023 - Inovasi Omics dengan AWS HealthOmics: Jalur Amgen menuju hasil yang lebih cepat
AWS Re:Invent 2023 - Membangun platform pengobatan presisi menggunakan AWS HealthOmics
Lokakarya End to End AWS HealthOmics - Presentasi (43:27)
AWS On Air menampilkan AWS HealthOmics & Data Terbuka (20:07)
Menggunakan AWS HealthOmics untuk Genomics End-to-End (2:03:06)
AWS On Air menampilkan Alur Kerja Ready2Run pada AWS HealthOmics (26:34)